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提到代谢组学峰比对，不得不提到一款老牌的比对软件，它就是MZmine2它发表于2010年，前身是MZmine，发表于2006年，可谓是十分经典的一款代谢组学峰比对软件MZmine 2的功能有很多，它是一款基于JAVA开发的开源软件，可以用于处理代谢组学profile数据，并且具有可视化和很多的分析功能MZmine 2的一部分功能基于R，所以首先需要安装R环境，并且安装一些依赖包：install.packages(c("Rserve", "ptw", "gplots", "baseline", "hyperSpec","ggplot2"))source("http://bioconductor.org/biocLite.R")biocLite("xcms")biocLite("CAMERA")biocLite("PROcess")运行mzmine并导入数据选中所有文件选中批量模式选中需要的配置文件点击OK开始分析分析好了结果已保存在E盘下可以查看比对的结果，提取出相应的保留时间和质荷比查看可以查看比对的基本信息查看比对的相关性点状图科研日精进已为大家下载好mzmine软件、测试数据及资料，需要的小伙伴↓↓↓关注我还有更多好用的科研小工具
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