- APP神圣官网 > 热点资讯 > 正文
SAMOVA是一款群体遗传结构分析软件,
可以用来对居群分组等下面我们就来介绍一具体的使用方法操作步骤准备好取样地点文件准备好遗传信息文件,可由dnasp等导出,注意,两个文件名必须一致,只是后缀不同运行samova2_console.exe,导入文件,选择数据类型选择距离计算方式设置gamma值与一些标准参数,再选择分为几组SAMOVA2.log为生成的日志文件SAMOVA2_short.log有简明的分组结果SAMOVA2_finaltruct_geo.arp为arlequin格式的文件SAMOVA2_finaltruct_geo.res为AMOVA的结果文件SAMOVA2_results_geo.htm是分组结果的地图文件以上是均匀考虑地理因素的结果,以下相应的就是不均匀的考虑地理因素的结果SAMOVA2_finaltruct_nogeo.arpSAMOVA2_finaltruct_nogeo.resSAMOVA2_results_nogeo.htm好了,以上就是使用使用SAMOVA对居群分组的操作如果文章对你有所帮助,请转发给你身边需要的人噢
科研日精进已为大家下载好SAMOVA软件、测试数据及资料,需要的小伙伴↓↓↓画出漂亮的序列比对图,只差一个CGView最优系统进化模型,用partitionfinder选选让插图更有质感
用AI绘制细胞膜双分子层图分析大量qPCR数据无从下手?试试R包吧用ChIPseeker对ChIP-seq数据进行可视化,图表直观颜值高分析代谢组数据,大名鼎鼎的xcms来了
关注我们Get更多科研小工具
联系我们
在线咨询:
0 评论