如何用SAMOVA(如何用文件科研精进数据)

SAMOVA是一款群体遗传结构分析软件,可以用来对居群分组等
下面我们就来介绍一具体的使用方法
操作步骤准备好取样地点文件准备好遗传信息文件,可由dnasp等导出,注意,两个文件名必须一致,只是后缀不同运行samova2_console.exe,导入文件,选择数据类型选择距离计算方式设置gamma值与一些标准参数,再选择分为几组SAMOVA2.log为生成的日志文件SAMOVA2_short.log有简明的分组结果SAMOVA2_finaltruct_geo.arp为arlequin格式的文件SAMOVA2_finaltruct_geo.res为AMOVA的结果文件SAMOVA2_results_geo.htm是分组结果的地图文件以上是均匀考虑地理因素的结果,以下相应的就是不均匀的考虑地理因素的结果
SAMOVA2_finaltruct_nogeo.arpSAMOVA2_finaltruct_nogeo.resSAMOVA2_results_nogeo.htm好了,以上就是使用使用SAMOVA对居群分组的操作
如果文章对你有所帮助,请转发给你身边需要的人噢
科研日精进已为大家下载好SAMOVA软件、测试数据及资料,需要的小伙伴↓↓↓画出漂亮的序列比对图,只差一个CGView最优系统进化模型,用partitionfinder选选让插图更有质感
用AI绘制细胞膜双分子层图分析大量qPCR数据无从下手?试试R包吧用ChIPseeker对ChIP-seq数据进行可视化,图表直观颜值高分析代谢组数据,大名鼎鼎的xcms来了
关注我们Get更多科研小工具
如何用SAMOVA(如何用文件科研精进数据)
(图片来源网络,侵删)

联系我们

在线咨询:点击这里给我发消息