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2018年8月,在辽宁沈阳出现了中国首例非洲猪瘟(African swine fever,ASF),随后该病迅速蔓延到各省市因为该病没有安全有效的疫苗也没有有效的药物,防控该病主要通过早发现、早处置,减少疫病的蔓延和扩散能够敏感的检测非洲猪瘟病毒的荧光PCR检测技术快速普及,大量的荧光PCR检测仪器和试剂快速推向市场,在帮助我国控制非洲猪瘟传播,阻断该病进入猪场的过程中起到了重要的作用我们对市场上的一些荧光PCR仪器进行了抽样检测,发现不同厂家的荧光PCR仪器检测性能存在较大差异1材料与方法1) 样本实验所检测的样本为现地获取的随机样本2) 检测试剂盒与检测方法验证实验采用瑞普(保定)生物药业有限公司生产的非洲猪瘟荧光PCR检测试剂盒进行检测试剂盒操作方法见说明书,分别采用核酸释放剂对样本进行快速裂解处理和DNA/RNA共提取试剂盒提取检测两种方法DNA/RNA共提取试剂盒采用湖南冠牧生物科技有限公司产品比对涉及设备3)仪器操作选择FAM通道检测ASFV-DNA,选择HEX或VIC通道检测参照反应程序设置如表一点击添加图片描述(最多60个字)编辑仪器使用参照仪器说明书进行4) 统计学处理采用Excel2007,通过计算变异系数(CV)比较不同实验的批内重复性2结果01A公司A型号设备使用免提取直接裂解法检测,分别在SLAN24P和A型号荧光PCR上检测,开启双通道模式,A型号检测Ct值与SLAN24P相比 ,FAM通道拖后3.7~11.7Ct,平均拖后5.8Ct,Hex通道拖后5.6~18.1 Ct,甚至HEX无法检出值检测敏感性降低10倍到数千倍使用免提取检测,SLAN24P内标CV为5.9%,免提取检测唾液样本,存在一定干扰,检测CV有一定偏差,但是在合理范围A生物A型号型号CV为97.8%,完全无法指示反应为了分析A型号性能明显异常原因,进一步对样本提取核酸后,使用单通道模式,只开启FAM通道进行检测在单通道模式下,A型号检测Ct值与SLAN24P相比 ,平均拖后1.3Ct需要注意的是核酸提取在8月13日完成,A型号仪器扩增在8月13日进行,SLAN24P仪器扩增在8月14日进行提取核酸放置过夜,Ct值大约拖后1~2 Ct02B公司B荧光PCR仪与SLAN24P比对结果使用免提取直接裂解法检测,分别在SLAN24P和B型号荧光PCR上检测, B型号检测Ct值与SLAN24P相比 ,FAM通道平均拖后2.9Ct检测敏感性降低接近10倍点击添加图片描述(最多60个字)编辑03C公司C型号荧光PCR仪与SLAN24P比对结果对SLAN24P和C型号荧光PCR仪开展了一系列实验进行检测使用免提取方法检测溶血样本SLAN24P检测内标正常,C型号内标无法显示,该设备对样本纯净性要求比较高,杂质含量高时可能影响检测结果两份阴性样本,提取核酸检测SLAN24P和C型号荧光PCR仪检测结果一致3份不同浓度样本,提取核酸检测SLAN24P全部检出,C型号荧光PCR仪一份样本未检出选取一份阳性样本提取核酸后104、105、106、107倍梯度,每个梯度设置3个重复,分别用SLAN 24P和C型号荧光PCR仪上机检测SLAN 24P和C型号荧光PCR仪检测Ct值无明显差异,检测内标CV分别为2.5%和1.8%,仪器孔间稳定性良好SLAN 24P仪器104、105、106倍梯度均可检出,107倍梯度稀释三个重复均未检出;C型号荧光PCR仪104、105梯度稀释均可检出,106倍梯度稀释二个重复检出一个未检出,107倍梯度稀释三个重复均未检出此次比对实验总共19份样本, SLAN 24P检出12份阳性,C型号荧光PCR仪检出10份阳性,SLAN 24P检测敏感性略高04上海宏石医疗科技有限公司SLAN24P与Roche Diagnostics Corp LC480、ABI公司7500、Q3、Q5型荧光PCR仪比对结果随机抽取一份血浆阳性样本10、102、103稀释,使用免提取检测,分别使用SLAN24P、ABI7500、ABI Q3、ABI Q5和Roche Diagnostics Corp LC480五款荧光PCR仪进行检测,三个厂家五个型号产品,检测Ct值没有明显差异,内标CV分别为0.3、0.5、1.8、0.2、0.5,仪器孔间差异小随机抽取一份血浆阳性样本提取核酸后10、102、103、104、105、106、107倍稀释,分别使用SLAN24P、ABI7500、ABI Q3、ABI Q5和Roche Diagnostics Corp LC480五款荧光PCR仪进行检测,三个厂家五个型号产品,检测Ct值没有明显差异,内标CV分别为0.2、0.2、0.7、1.4、0.9,仪器孔间差异小五款仪器10、102、103、104、105倍稀释均可检出,106稀释ABI7500未检出,107稀释均未检出,五款仪器总体敏感性无显著差异3结论上海宏石医疗科技有限公司 SLAN24P荧光PCR仪与进口品牌ABI7500、ABI Q3、ABI Q5和Roche Diagnostics Corp LC480荧光PCR仪定量Ct值、检测敏感性无明显差异,孔间差异小A公司A型号荧光PCR仪标称四通道设备,实际上第二通道都无法使用,只能使用单通道在单通道模式下检测Ct值相对SLAN24P荧光PCR仪拖后1.3以上B公司B型号荧光PCR仪检测Ct值相对SLAN24P荧光PCR仪平均拖后2.9Ct检测敏感性低接近10倍C公司C型号荧光PCR仪定量Ct值与SLAN24P荧光PCR仪无明显差异,孔间差异小弱阳性样本检测和梯度稀释实验检测敏感性略逊于SLAN24P荧光PCR仪在复杂样本方面,C公司仪器表现性相对SLAN24P荧光PCR仪较差4讨论非洲猪瘟防控过程中,生物安全防控和精准清除是目前实用最广泛的防控手段,猪场通过采集环境拭子、唾液、鼻咽拭子等对非洲猪瘟病毒进行早发现,这些样本中病毒含量通常都非常低,检测敏感性差的设备可能导致大量阳性样本漏检,检测失去意义在非洲猪瘟防控过程中,荧光PCR仪选择首要考虑仪器敏感性目前有大量敏感性欠缺的设备充斥市场,可能导致生物安全防控和精准清除失败要保证检测结果准确可靠,荧光PCR试剂需要有内参照,以监控每个反应孔是否成立真实、稳定的双通道设备应该是荧光PCR仪最基础的配置随着疫苗的推出,检测过程中需要对野毒和疫苗毒鉴别;在对疫病进行快速鉴别时,涉及到三种疫病进行鉴别诊断,有条件的养殖场最好配备四通道检测设备目前也有很多标称二通道或者四通道的荧光PCR第二通道或者三、四通道无法使用,需要对设备进行验证实验荧光PCR检测除了定量检测Ct值具有重要的定量意义,例如圆环病毒病检测不同的Ct值,可能对实际生产具有完全不同的指示意义在非洲猪瘟检测过程中,不同的Ct值,也需要采取不同等级的生物安全措施荧光PCR仪保证Ct值准确、稳定、可靠也非常重要(完)
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