EddyPro 涡度协方差数据分析软件使用方法EddyPro简介：EddyPro®是一款功能强大的涡度协方差数据处理软件，用于计算CO2、H2O、CH4等其它痕量气体（如：NH3）及能量通量。
相比于其他通量计算软件，EddyPro具有界面友好，简便易学的优点。
数据准备在使用EddyPro软件计算分析通量前，需要对数据进行预处理。
格式转化针对Campbell公司的CR系列数据采集器采集存储的数据，我们需要如下步骤：Loggernet➡Data➡Cardconvert，数据切割工具将其数据转化为TOA5文本数据格式。
其操作如下：①选择需要格式转化的文件位置②设置转化后目标输出文件位置③转化格式设置 ：设置文件输出格式和对文件进行切割勾选Use time和TimeDate Filename：可对转换后的文件按照时间格式命名Start Time：根据原始数据采集设置日期，时间的设置需要从整点或半点开始，如13:00:00或13:30:00切割时间设置：Interval栏设置切割时长点击Start conversion开始转换。
由此便将CR系列数据采集的数据成功转换为TOA5格式了。
EddyPro软件数据处理3.1 新建工程文件打开EddyPro软件，进入EddyPro软件最初设置界面。
点击”New Project” ，新建一个工程文件。
Project name :设置文件名，文件名中不能含有中文信息。
Raw file format:EddyPro软件可以识别的数据格式，这里TOA5格式应选择”ASCⅡ Plain text”。
进入Metadata File Editor编辑界面。
3.2 Metadata File Editor界面该界面主要包含：①Station：站点信息②Instruments:仪器详情③Raw File Description：数据描述。
3.2.1 Station：站点信息①Timestamps refers to：选择beginning of dataset period。
指读取数据的时间序列从头开始。
② File duration：设置文件数据时长，根据具体情况进行设置。
最大可选时长为1440min即1day。
通常设置时长为30min。
③Acquisition frequency：时间序列数据的采样频率。
海尔欣科技氨气分析仪HT-8700E采样频率为10HZ，这里选择10HZ。
④Canopy height ：冠层高度必须填。
( 城市冠层高度：地面到建筑物顶的高度) 。
如果仪器安装在农田等，只需要填写农田植被高度与地面的距离。
⑤displacement height: 零平面位移，如果不填，系统会自动根据冠层高度估算（不大于冠层高度） 。
⑥Altitude：海拔高度，仪器安装海拔高度。
⑦Latitude ：纬度，仪器安装所处纬度。
⑧Longitude：经度，仪器安装所处经度。
3.3 Instruments:仪器详情Instruments:仪器详情界面需要填写Anemometer Info（三维风速仪）信息和Gas Analyzers Info (气体分析仪信息)。
如果有多种气体分析仪，可以在气体分析仪点击右上角“+”和“-”进行添加和删除仪器信息。
风速仪（三维风速仪）需要填写信息：①Manufacturer：制造商 ②Model：型号 ③Height：指地面到仪器光路中心的距离 ④wind data format：风向资料格式 ⑤North offset: 参照当地磁北极的偏移角度，往北为正。
气体分析仪需要填写信息：①Manufacturer：制造商②Model：型号。
③Northward separation: 以为三维风速仪中心参考，当前气体分析仪测量池中心与三维风速仪中心南北方向上的距离。
如果气体分析仪在三维风速仪的北边，则为正。
④Eastward Separation ：以为三维风速仪中心参考，当前气体分析仪测量池中心与三维风速仪中心东西方向上的距离。
如果气体分析仪在三维风速仪的北边，则为正。
⑤Vertical separation ：以为三维风速仪中心参考，当前气体分析仪测量池中心与三维风速仪中心垂直方向上的距离。
如果气体分析仪在三维风速仪的上方，则为正。
⑥Longitudinal path length ：开放气体分析仪测量池的长度，海尔欣科技的HT-870E取50cm。
⑦Transversal path length: 气体测量池的直径。
海尔欣科技的HT-8700E 取值8cm。
3.4 Raw File Description：数据描述在使用EddyPro软件设置数据描述前，我们需要查看数据表头，从而进行EddyPro的Raw File Description：数据描述菜单的设置。
查看数据表头：我们用打开转化后的TOA5文本格式的数据，如下图：表头共四行，第一行为数据格式说明及数采信息；第二行为变量标签；第三行为变量单位；第四行为变量统计方法；Raw File Description：数据描述菜单的设置格式：Number of header rows（表头行数）一定要写，否则无法运行。
从表头文件第二行中有：前三列分别为时间标签和数据序列记录，处理时不参与计算，所以将其忽略。
不需要的数据列，都可将“Ignore”设置为“yes”，而时间列不是数字格式，“Numeric”设置为“no”。
其余变量需按照数据文件的信息顺序录入。
有些变量名在下拉列表中找不到，可以手动输入。
设置完成后需要点击“”，存储路径中不得含有中文。
EddyPro软件输出设置我们新建一个EddyPro文件，用来作为运行EddyPro需要处理的数据文件。
3.1 Basic setting：基本设置①Raw data directory: Raw file name format：原始文件命名格式，即转换好的TOA5格式文件的统一命名规则。
如：文件名为TOA5_8700_2020-06-19_0000.dat，则此处填写TOA5_????_yyyy-mm-dd_HHMM.dat。
③Output directory:输出文件位置，路径中不得有中文字符④Missing samples allowance:允许缺失数据比例⑤Flux averaging interval：输出数据平均周期其中30%，指容许的数据剔除数量；30min，指数据平均计算周期。
变量设置变量的选择对应数据描述菜单，设置需要计算的通量数据及其对应的气体分析仪。
Advanced settings高级设置中包含了通量数据校正的计算的一系列过程。
坐标旋转：在右边的下拉选项中可以选择合适的方式。
一般选用二次坐标旋转去趋势：在右边的下拉选项中可以选择合适的算法。
时间迟滞补偿：在右边的下拉选项中可以选择合适的算法。
WPL校正：一般默认勾选。
其余参数均按照默认选项进行计算即可。
运行EddyPro程序EddyPro程序有两种运行模式：Express Mode（快速运行模式）和Advanced Mode（高级运行模式），如若运行高级模式可以根据需要设置Advanced Settings中的内容。
点击“Express Mode（快速运行模式）或Advanced Mode（高级运行模式）”按键，就可以运行EddyPro程序了。
程序运行需要等待一段时间，程序运行结束出现如下界面点击“Open the output folder”查看输出文件其中的”eddypro_default_full_out_”命名开头文件，即为计算结果输出文件xx_flux列为通量计算结果。