版权问题选择计算软件DFT(计算软件版权问题小王商业软件)「版权指计算机软件所有」

接触计算之前,相信很多小伙伴对计算软件的选用非常头疼。
在此小王对常用的几种软件简单介绍一下,以备大家学习前的选择。
一、VASPVASP全称Vienna Ab-initio Simulation Package,是维也纳大学Hafner小组开发的进行电子结构计算和量子力学-分子动力学模拟软件包。
VASP是目前主流的第一性原理计算软件,对于周期性体系、金属及团簇等体系有着优异的计算。
但是其作为商业性软件对初学者不太友好。

但是并不影响自己学习使用。
VASP目前仅有linux版本。
VASP作为商用软件,具有版权是非常重要的,开发公司会有专门的部门对发表的文章进行审查,对于没版权发表的文章通常会被撤稿以及所属机构会被拉入黑名单。
相信大家看到这里,应该明白VASP软件本身没有是否正版之分,而版权也仅仅是购买者/机构在VASP开发公司留存的购买信息。
也就是说,使用VASP发表文章一般是需要购买者/机构在文章中体现(如共同作者or致谢)。
近期有公司发布了拥有VASP版权的服务商,找代算的小伙伴可以留意一下,一定要找有版权的机构。
(图片摘自源资科技)二、Materials StudioMS,全称Materials Studio,是少有的能在win系统上操作的计算模拟软件(常见的除此之外仅有Gaussian了)。
并且与商业软件Gaussian一样,具有集模型构建、计算及后处理于一体的商业软件。
目前,使用MS进行第一性原理计算,几乎与VASP一样热门。
不过业内人士一般认为,MS全程仅用鼠标就可完成全部计算过程,入门的门槛太低,且由于昂贵的费用,因此接受度相比于其他软件低得多,据了解完整的一套MS得上百万了。
MS除了有win版本,也有linux版本。
值得一提的是,对于任何计算软件,它在win系统下的CPU、内存等资源利用率很低,而在linux系统下几乎能达到100%的利用率,这就是为什么推荐大家使用linux系统的原因。
最后,MS作为商业软件,它和VASP一样需要版权才能发表文章。
使用MS发表文章一般也是需要购买者/机构在文章中体现(如共同作者or致谢),大家找代算机构或者合作发表文章的时候一定要注意版权问题,以保证自己的权益,千万不要被忽悠了。
三、GaussianGaussian是一款功能非常强大的量子化学综合软件包,同时它也是商业软件。
其主要对象:分子、团簇等孤立体系。
体系大小:几个至几十个、几百个原子。
能够计算的内容包括:①基于分子结构:几何优化振动分析热力学量光谱计算:IR、RAMAN、NMR、VCD......势能面扫描分子稳定性、反应活性分析体积、静电势、原子电荷、分子轨道激发态与电子光谱、ECD......弱相互作用②基于反应过程过渡态搜索IRC(反应路径)计算反应速率常数反应能垒反应机理③溶剂体系④周期性体系Gaussian计算的优点:功能全面,一般性的化学问题都能计算;图形界面友好;跨平台,使用简单;结构和能量计算准确,精度高。
缺点:振动计算效率低;输出信息繁杂;Windows平台资源限制;收费。
Gaussian作为商业软件还是挺便宜的,曾在墨灵格信息科技公司购买美国高斯公司正版G16的linux版本,加税也仅三万多。
购买软件时关于版权问题得到的说法是:用软件发文章只能是采购者,或者本校区经采购者同意后借用光盘安装的老师(需知会美国)。
也就是说文章的发表要么挂上采购者的名,要么就必须是在美国公司有留底的许可人发表。
与前面两种商业软件相同,Gaussian软件可以作为学习使用,但是发表文章一定要有版权,否则会受到撤稿拉黑名单的惩处。
四、ORCAORCA是一款开源的量子化学程序,发展迅猛,流行程度越来越高,用户也越来越多,在各大期刊上经常见到它的身影。
官网:https://orcaforum.kofo.mpg.de/app.php/portal如果大家觉得Gaussian这个商业软件太贵买不起的话,可以考虑使用ORCA。
ORCA作为Gaussian的备胎,基本具备其计算的功能,目前已经更新到5.0版本,不过小王还是觉得4.2很好用。
与Gaussian相同,ORCA既有linux版本,也有win版本。
使用了几年的ORCA-linux版本,感觉很多地方比Gaussian还更有优势,非常不错。
但是很多人应该还是不了解ORCA,认为只有Gaussian这样的量子化学计算软件才靠谱,是不是计算一定要用特定的软件呢?当然不会。

这中间存在一个误区,就是想要计算的人通常在文献中看到使用某个软件计算的,所以自己也要用这个软件,否则就会算的不对。
这个理解当然是不对的。
在计算中量子化学和第一性原理的软件是有很大差异,比如周期性结构适用于第一性原理软件而不适用于量化软件。
而对于同样是量子化学软件,基本上这个软件能算的内容,另一个软件也能算。
而对于担忧版权的小伙伴,ORCA一定是你最佳选择。

五、CP2KCP2K是一个速度非常快,功能又比较全面的第一性原理程序。
这个软件不仅开源免费,而且跑中、大周期性体系比Quantum ESPRESSO、VASP等速度快得多。
官网:https://www.cp2k.org/开源软件尽管不要版权,但是学习起来相对比较困难,学习资源/料少,对于初学者不太友好。
CP2K只有linux版本,建议先有一定的基础再尝试。
而对于担忧版权的小伙伴,CP2K也一定是你得最佳选择。

六、Quantum ESPRESSOQuantum ESPRESSO(QE)是用户非常多、极为流行的第一性原理程序,而且完全开源免费。
官网:https://github.com/QEF/q-e/releasesQE与VASP的关系就像ORCA与Gaussian的关系一样,如果考虑经济问题,完全可以选择VASP的备胎QE,能够计算VASP所能计算的任务。
QE目前在各大期刊上也是使用广泛,而目前QE也只有linux版本。
最后提醒大家:使用商业软件一定要注意版权问题。

版权体现在文章的挂名、致谢中。

开源软件更香。





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